インストール - NCL tips

NCL公式ホームページのダウンロードに従う。 基本的に自分の計算機環境にあったbinaryファイルをダウンロードして展開しパスを通すだけ。
ソースコードをダウンロードして自分でビルドすることも可能であるが，公式はおススメしていない（もしそうしたいならGood Luck!とのこと）。

なお，比較的新しい環境ではgfortranのバージョンの違いなどから，公式のbinaryファイルが使えない可能性が高い。今はCondaによるインストールが可能になったので，好みや環境によってはこちらのほうが便利である。詳細は公式ページのInstalling NCL with "conda"を参照のこと。


Condaを使う(Linux)†

Anacondaはサイズが大きいので，ここではその簡易版であるMinicondaを使う
https://docs.anaconda.com/miniconda/に行って適切なインストーラーをダウンロード（Miniconda3-latest-Linux-x86_64.shというファイル名とする）

$ mkdir miniconda3
$ ./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -b -u -p ~/miniconda3
$ ~/miniconda3/bin/conda init bash

ログイン時に勝手にactivateされる（(base)が表示される）のが嫌であれば，次で無効化

$ conda config --set auto_activate_base False

インストールしたcondaにNCLの仮想環境を作成する

$ conda create -n ncl -c conda-forge ncl  # ここでは ncl を環境名とする。好きな名前でよい。
                                          # conda create -n [環境名]

作られた環境 "ncl" を activate するには，

$ conda activate ncl

を実行する。
deactivate するには，

$ conda deactivate

を実行する。


↑

Condaを使わない†

↑

Linux †

$ uname -m

で出たハードウェアのタイプ（たぶん x86_64 か i686 だと思う。）

$ cat /etc/issue

でLinuxのバージョン

$ gcc --version

でgccのバージョン（ gcc4.4.7 みたいに出る) を調べて，合ったものをDL。
Linuxのディストリビューションによっては、

$ sudo apt-get install ncl-ncarg

でもインストール可能だが，最新バージョンではない可能性がある。それほどの手間ではないので，自分で最新版をダウンロードするのがよいだろう。


↑

Mac†

$ sw_vers –productVersion

でOSの種類(10.9.2とか10.10とか)

$ uname -m

で出たハードウェアのタイプ（たぶん x86_64 か i686 だと思う。）

$ gcc –version

でgccのバージョン( gcc4.4.7 みたいに出る) を調べて，合ったものをDL


↑

Windows (Cygwin)†

NCLはファイル名に CYGWIN が含まれているものをダウンロードする。Cygwin自体のインストールや設定の詳細に関してはここでは省略するが，NCLを使うには必ず32bit版のCygwinをインストールすること。NCLをインストールする前に，CygwinやCygwin/Xを使うための環境変数の設定を忘れずに。 なお，必要なパッケージはNCLの公式ページによれば以下の通りである。

Develカテゴリ："autoconf", "binutils", "bison", "byacc", "flex", "gcc", "gcc4", "gcc4-fortran", "gcc-g++", "gdb", "make", "makedepend", "openssl-devel"

Libsカテゴリ："expat", "libcurl3", "libexpat-devel", "libgfortran3", "libidn-devel", "libxml2", "libtirpc", "zlib"

Netカテゴリ："libcurl-devel", "libcurl4", "openssh"

Shellsカテゴリ： "bash", "sh-utils", "pdsh", "tcsh"

X11カテゴリ：すべてインストールすることが望ましい

選択肢にないものもあったが，とりあえずそれっぽい物を入れたら上手くいった。


↑

Windows (Windows Subsystem for Linux)†

(今はWSL2が利用可能となりましたが，以下はWSL1についての記述のままです。)
Windows10では，Windows上でLinux環境を使用できるWindows Subsystem for Linux (WSL)が標準搭載されており，これを利用するのが便利である。ここではWSLを用いてUbuntuを動かしてNCLをインストールする方法を紹介する。
WSLはデフォルトでは無効化されているため，「コントロールパネル→プログラム→Windowsの機能の有効化または無効化」から，Windows Subsystem for Linuxを有効にする。有効化後，再起動が求められる。再起動したら，Microsoft Storeへ行って，(例えば)Ubuntu 18.04 LTSをダウンロードする。実行するとインストールが始まり，Ubuntuで使用するユーザー名とパスワードが要求されるので適宜入力する。
Ubuntu環境のインストールが終わったら，まずはアップデートを必ず行う。

$ sudo apt update
$ sudo apt upgrade

もちろん最初だけでなく定期的に行うようにしよう。なお，aptの進捗が途中で止まったように見えることがあるが，Enterを押下すれば進む。

さて，WSL単独ではX Windowが使用できないので，これを別途インストールする。Windowsで利用できるXサーバーソフトには様々なものがあるが，ここではVcXsrvを利用する。VcXsrvのインストーラーをhttps://sourceforge.net/projects/vcxsrv/からダウンロードし，実行する。基本的にはデフォルトのまま進めればよいだろう。無事に実行できると，ツールバーにXのアイコンが表示される(なおVcXsrvはWSLを立ち上げても自動的には起動しない)。DISPLAY環境変数を，bashであれば，

$ export DISPLAY=localhost:0.0

で設定し，

$ sudo apt install x11-apps x11-utils x11-xserver-utils dbus-x11

でUbuntu上にx11をインストールしてから，

$ xeyes

を実行しておめめが出てくれば成功。もちろん環境変数の設定は.bashrcなどに書いておくことが望ましい。

そして，以下のパッケージを追加する。

$ sudo apt install csh libfontconfig gfortran libgfortran3
$ sudo apt install libxrender-dev libx11-dev libxrender1
$ sudo apt install libssh2-1 libgomp1
$ sudo apt install imagemagick

ImageMagickは必ずしも必要ではないが，画像編集で重宝するので入れておくとよい。なお，最新のImageMagickでは脆弱性への対応により，使用できるファイル形式がかなり絞られている。epsやpdfなどを扱いたいときには，/etc/ImageMagick-6/などにあるpolicy.xmlを編集し，disable format typesから除外することが必要(当然セキュリティ的なリスクを伴うことになるので注意)。
NCLのbinaryファイルは，Ubuntuに合うものをダウンロードすればよい(Linux参照)。

ところで，私がNCLを展開後に実行したときには，libiconv.so.2がないというエラーが出たので，もしそうなった場合の対処法を記しておく。まずiconvをインストールする。

$ wget http://ftp.gnu.org/pub/gnu/libiconv/libiconv-1.16.tar.gz
$ tar zxvf libiconv-1.16.tar.gz
$ cd libiconv-1.14
$ ./configure
$ sudo apt install make  (makeがなかったので)
$ make
$ sudo make install

ここで，

$ iconv --version

とすると，同じようなlibiconv.so.2に関するエラーを吐くと思う。そこで，/etc/ld.so.conf に /usr/local/lib を追記する。そして，

$ sudo ldconfig

を実行すると上手くいった。

ちなみに，Cドライブには，

$ cd /mnt/c

でアクセス可能である。例えば，/mnt/c/Users/(ユーザー名)/workというディレクトリを作成しておいて，

$ ln -s /mnt/c/Users/(ユーザー名)/work ~/work

のようにUbuntuのホームディレクトリにリンクを作成しておけば，WindowsからもUbuntuからも利用しやすくなる。また，USBドライブなどにアクセスするためには，Ubuntu上で適当なマウントポイントを作り，mountする必要がある。例えば，USBのWindows上でのドライブ名がf:，マウントポイントを/mnt/usbとする場合，

$ sudo mkdir /mnt/usb
$ sudo mount -t drvfs f: /mnt/usb/

とすればよい。アンマウントは，

$ sudo umount /mnt/usb/

で行う。



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以上，各OS，ぴったりなものがなくてもだいたい近いものをDLして展開すれば動くと思う。


まず，DLしたファイルを適当なディレクトリに展開する。例えば，

$ mkdir /usr/local/ncl-6.5.0
$ tar -zxf ~/ncl_ncarg-6.5.0-Debian8.11_64bit_gnu492.tar.gz -C /usr/local/ncl-6.5.0

とする。すると中にbin, lib, includeがあるので binにPATHを通す。bashの場合，

$ export NCARG_ROOT=/usr/local/ncl-6.5.0
$ export PATH=$NCARG_ROOT/bin:$PATH

としておく。
NCARG_ROOTという環境変数は組み込み関数を含むスクリプトのloadや描画に用いるcolormapファイルの置き場の指定など様々な場面で用いられるので，ここでセットしといたほうがよい。.bashrcなどに書き込んでおくのが無難。


インストールしたら

$ ncl

とし，

Copyright (C) 1995-2015 - All Rights Reserved
University Corporation for Atmospheric Research
NCAR Command Language Version 6.3.0
The use of this software is governed by a License Agreement. 
See http://www.ncl.ucar.edu/ for more details. 
ncl 0>

みたいに出たら成功。 この状態をinteractive mode という。 NCLはgradsやgnuplotのようにコマンドラインで操作することも可能だが，メリットはないので，ここではバッチジョブ実行のやり方を説明する。やり方はNCLスクリプト「.nclファイル」を作って

$ ncl hoge.ncl

とするだけである。

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